| East A | Số trận | Thắng | Hòa | Bại | Hiệu số | Điểm | |
| 1 | Vegalta Sendai | 16 | 10 | 5 | 1 | 18 | 40 |
| 2 | Shonan Bellmare | 16 | 8 | 4 | 4 | 10 | 31 |
| 3 | Blaublitz Akita | 16 | 9 | 2 | 5 | 6 | 29 |
| 4 | SC Sagamihara | 16 | 7 | 4 | 5 | 3 | 27 |
| 5 | Yokohama FC | 16 | 6 | 3 | 7 | 3 | 23 |
| 6 | Thespakusatsu Gunma | 16 | 5 | 4 | 7 | -13 | 20 |
| 7 | Montedio Yamagata | 16 | 5 | 2 | 9 | -4 | 19 |
| 8 | Tochigi City FC | 16 | 4 | 4 | 8 | -15 | 18 |
| 9 | Tochigi SC | 16 | 4 | 4 | 8 | -4 | 17 |
| 10 | Vanraure Hachinohe | 16 | 4 | 4 | 8 | -4 | 16 |
| East B | Số trận | Thắng | Hòa | Bại | Hiệu số | Điểm | |
| 1 | Ventforet Kofu | 16 | 10 | 1 | 5 | 8 | 32 |
| 2 | Iwaki FC | 16 | 7 | 4 | 5 | 4 | 28 |
| 3 | Consadole Sapporo | 16 | 8 | 2 | 6 | 2 | 28 |
| 4 | Omiya Ardija | 16 | 8 | 2 | 6 | 9 | 27 |
| 5 | FC Gifu | 16 | 8 | 2 | 6 | 0 | 27 |
| 6 | Fujieda MYFC | 16 | 5 | 8 | 3 | 1 | 26 |
| 7 | Matsumoto Yamaga | 16 | 6 | 4 | 6 | 10 | 23 |
| 8 | Jubilo Iwata | 16 | 4 | 6 | 6 | -5 | 22 |
| 9 | Fukushima United | 16 | 4 | 3 | 9 | -10 | 16 |
| 10 | Nagano Parceiro | 16 | 2 | 4 | 10 | -19 | 11 |
| West A | Số trận | Thắng | Hòa | Bại | Hiệu số | Điểm | |
| 1 | Kataller Toyama | 16 | 10 | 4 | 2 | 17 | 37 |
| 2 | Kochi United SC | 16 | 8 | 4 | 4 | 5 | 30 |
| 3 | Albirex Niigata | 16 | 7 | 5 | 4 | 2 | 29 |
| 4 | Tokushima Vortis | 16 | 9 | 1 | 6 | 14 | 28 |
| 5 | Ehime FC | 16 | 7 | 3 | 6 | 7 | 25 |
| 6 | Zweigen Kanazawa | 16 | 4 | 6 | 6 | -8 | 22 |
| 7 | FC Imabari | 16 | 5 | 3 | 8 | -3 | 19 |
| 8 | Nara Club | 16 | 4 | 4 | 8 | -12 | 18 |
| 9 | FC Osaka | 16 | 3 | 6 | 7 | -3 | 17 |
| 10 | Kamatamare Sanuki | 16 | 4 | 2 | 10 | -19 | 15 |
| West B | Số trận | Thắng | Hòa | Bại | Hiệu số | Điểm | |
| 1 | Tegevajaro Miyazaki | 16 | 14 | 1 | 1 | 23 | 43 |
| 2 | Sagan Tosu | 16 | 8 | 4 | 4 | 10 | 30 |
| 3 | Kagoshima United | 16 | 6 | 5 | 5 | 3 | 27 |
| 4 | Renofa Yamaguchi | 16 | 7 | 3 | 6 | 2 | 26 |
| 5 | Roasso Kumamoto | 16 | 8 | 1 | 7 | 1 | 25 |
| 6 | Oita Trinita | 16 | 6 | 2 | 8 | 1 | 21 |
| 7 | Gainare Tottori | 15 | 4 | 4 | 7 | -7 | 19 |
| 8 | MIO Biwako Shiga | 15 | 5 | 1 | 9 | -13 | 16 |
| 9 | Giravanz Kitakyushu | 16 | 4 | 3 | 9 | -10 | 15 |
| 10 | FC Ryukyu | 16 | 2 | 6 | 8 | -10 | 15 |