Năm nay mới 18 tuổi nhưng Kubo đã có màn ra mắt đội tuyển quốc gia Nhật Bản trong trận đấu với El Salvador vào hôm 9/6 vừa qua. Cầu thủ sinh năm 2001 ra sân 13 lần, ghi 4 bàn tại J.League trong màu áo CLB FC Tokyo.
Năm 2016, Kubo thuộc thành phần của đội U16 Nhật Bản tham dự VCK châu Á. Các chiến binh samurai trẻ tuổi đã có chiến thắng đậm 7-0 trước tuyển U16 Việt Nam ở trận ra quân. Ở trận đấu đó, Kubo đã lập cú đúp.
1,7 triệu bảng là khoản tiền Real bỏ ra để sở hữu cầu thủ được mệnh danh là "Messi xứ mặt trời mọc". Trước đó vào năm 2011, Kubo từng ký hợp đồng với Barcelona. 4 năm sau, anh phải trở về quê nhà thi đấu do FIFA xác định hàng loạt sai phạm của Blaugrana trong quá trình chiêu mộ cầu thủ ngoài châu Âu.